黄芪泡水虽然能起到不错的功效，如美白肌肤、利水消肿以及预防感冒，但是如果出现患有一些疾病，是不能泡黄芪喝的。感冒发热的人不能喝黄芪茶饮，3种肾虚的人也要慎重用黄芪泡水喝。黄芪泡水最好在早上饮用，不要在睡前或者身体不适的时候饮用。在泡黄芪喝之前，最好将黄芪浸泡15-20分钟，之后再放入锅中煎煮，更能发挥黄芪的功效。
3种肾虚，即肾阴虚、湿热、热毒炽盛，有这3种症状的人是不能单独泡黄芪喝的，最好和黄连、栀子、大黄、败酱草等一起泡，否则不补反而对身体造成影响。除了3种肾虚的人需要加入其它材料冲泡外，患有肺结核病，有发热、口干唇燥、咯血等症状等人也是不能单独泡黄芪喝的。
月经期间不适宜用黄芪泡水喝，此外，孕妇也不能喝。黄芪就有利尿的功效，有可能会令羊水较少，这样会延长产程，宝宝处境危险。有研究表明黄芪可使染色体畸变率和细胞微核率明显增高，因此孕妈咪还是不要跑黄芪喝为好。